Tu najdemo veliko število ptičev, saj so soline primerne za gnezdenje, pestre so s hrano za ptiče in tu najdemo brakično vodo. V starih hišah gnezdijo tudi sove.
V Sečoveljskih solinah je bilo zaznanih preko 290 vrst ptic (čez 500 jih je po celi Evropi), od tega jih 40 vrst tu gnezdi.
Sečoveljske soline so zelo pomembne za prezimovanje in selitev ptic.
Ptiči: rumenonogi galeb, navadna čigra, mala čigra, mala bela čaplja, plamenec, polojnik, sabljarka, duplinska kozarka, rdeče- in zelenonogi martinec, kormoran…